Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FXNQ16595 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FXNQ16595 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FXNQ16595 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FXNQ16595 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FXNQ16595 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FXNQ16595 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FXNQ16595 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FXNQ16595 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FXNQ16595 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FXNQ16595 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FXNQ16595 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FXNQ16595 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FXNQ16595 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FXNQ16595 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FXNQ16595 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FXNQ16595 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FXNQ16595 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FXNQ16595 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FXNQ16595 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FXNQ16595 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FXNQ16595 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FXNQ16595 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FXNQ16595 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FXNQ16595 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FXNQ16595 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FXNQ16595 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FXNQ16595 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FXNQ16595 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FXNQ16595 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FXNQ16595 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FXNQ16595 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FXNQ16595 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FXNQ16595 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FXNQ16595 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FXNQ16595 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FXNQ16595 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FXNQ16595 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FXNQ16595 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FXNQ16595 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FXNQ16595 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FXNQ16595 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FXNQ16595 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FXNQ16595 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FXNQ16595 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FXNQ16595 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FXNQ16595 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FXNQ16595 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FXNQ16595 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FXNQ16595 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FXNQ16595 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FXNQ16595 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FXNQ16595 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FXNQ16595 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FXNQ16595 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FXNQ16595 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FXNQ16595 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FXNQ16595 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXNQ16595 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXNQ16595 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXNQ16595 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXNQ16595 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXNQ16595 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXNQ16595 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FXNQ16595 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FXNQ16595 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FXNQ16595 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FXNQ16595 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FXNQ16595 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FXNQ16595 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FXNQ16595 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FXNQ16595 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FXNQ16595 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FXNQ16595 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FXNQ16595 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FXNQ16595 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FXNQ16595 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FXNQ16595 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FXNQ16595 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FXNQ16595 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FXNQ16595 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FXNQ16595 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FXNQ16595 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FXNQ16595 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FXNQ16595 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FXNQ16595 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FXNQ16595 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FXNQ16595 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FXNQ16595 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FXNQ16595 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FXNQ16595 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FXNQ16595 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FXNQ16595 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FXNQ16595 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FXNQ16595 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FXNQ16595 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FXNQ16595 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FXNQ16595 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FXNQ16595 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FXNQ16595 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms