Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP3Q15836 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP3Q15836 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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