Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMC1AQ14683 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC1AQ14683 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC1AQ14683 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC1AQ14683 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
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