Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CNGB1Q14028 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CNGB1Q14028 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CNGB1Q14028 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CNGB1Q14028 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CNGB1Q14028 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CNGB1Q14028 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CNGB1Q14028 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CNGB1Q14028 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CNGB1Q14028 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CNGB1Q14028 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CNGB1Q14028 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CNGB1Q14028 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CNGB1Q14028 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CNGB1Q14028 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CNGB1Q14028 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CNGB1Q14028 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CNGB1Q14028 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CNGB1Q14028 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CNGB1Q14028 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CNGB1Q14028 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CNGB1Q14028 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CNGB1Q14028 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CNGB1Q14028 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CNGB1Q14028 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CNGB1Q14028 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CNGB1Q14028 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CNGB1Q14028 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CNGB1Q14028 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CNGB1Q14028 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CNGB1Q14028 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CNGB1Q14028 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CNGB1Q14028 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CNGB1Q14028 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CNGB1Q14028 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CNGB1Q14028 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CNGB1Q14028 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CNGB1Q14028 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CNGB1Q14028 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CNGB1Q14028 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CNGB1Q14028 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CNGB1Q14028 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CNGB1Q14028 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CNGB1Q14028 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CNGB1Q14028 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CNGB1Q14028 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CNGB1Q14028 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CNGB1Q14028 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CNGB1Q14028 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CNGB1Q14028 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CNGB1Q14028 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CNGB1Q14028 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CNGB1Q14028 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CNGB1Q14028 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CNGB1Q14028 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CNGB1Q14028 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CNGB1Q14028 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CNGB1Q14028 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
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