Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRR1Q13601 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRR1Q13601 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRR1Q13601 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
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