Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.55□□□□□ -1.36
MSH5Q12175 COX5AYNL052W 462 nt6.55□□□□□ -1.36
MSH5Q12175 RGD1YBR260C 2001 nt6.54□□□□□ -1.36
MSH5Q12175 YIL168WYIL168W 384 nt6.54□□□□□ -1.36
MSH5Q12175 PAU15YIR041W 375 nt6.54□□□□□ -1.36
MSH5Q12175 DSC3YOR223W 879 nt6.54□□□□□ -1.36
MSH5Q12175 AIM3YBR108W 2844 nt6.54□□□□□ -1.36
MSH5Q12175 YGR127WYGR127W 939 nt6.53□□□□□ -1.36
MSH5Q12175 ERP2YAL007C 648 nt6.53□□□□□ -1.36
MSH5Q12175 YKR032WYKR032W 315 nt6.53□□□□□ -1.36
MSH5Q12175 CSC1YLR241W 2349 nt6.53□□□□□ -1.36
MSH5Q12175 RSA4YCR072C 1548 nt6.52□□□□□ -1.37
MSH5Q12175 PSA1YDL055C 1086 nt6.52□□□□□ -1.37
MSH5Q12175 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.52□□□□□ -1.37
MSH5Q12175 TOS6YNL300W 309 nt6.52□□□□□ -1.37
MSH5Q12175 YBR232CYBR232C 360 nt6.52□□□□□ -1.37
MSH5Q12175 KEL1YHR158C 3495 nt6.52□□□□□ -1.37
MSH5Q12175 DUS4YLR405W 1104 nt6.51□□□□□ -1.37
MSH5Q12175 YML6YML025C 861 nt6.51□□□□□ -1.37
MSH5Q12175 SKI2YLR398C 3864 nt6.5□□□□□ -1.37
MSH5Q12175 PET117YER058W 324 nt6.5□□□□□ -1.37
MSH5Q12175 ATP23YNR020C 813 nt6.5□□□□□ -1.37
MSH5Q12175 KTR5YNL029C 1569 nt6.49□□□□□ -1.37
MSH5Q12175 YDR415CYDR415C 1125 nt6.49□□□□□ -1.37
MSH5Q12175 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt6.49□□□□□ -1.37
MSH5Q12175 ATG22YCL038C 1587 nt6.48□□□□□ -1.37
MSH5Q12175 MIP1YOR330C 3765 nt6.48□□□□□ -1.37
MSH5Q12175 SKP1YDR328C 585 nt6.48□□□□□ -1.37
MSH5Q12175 TRS31YDR472W 852 nt6.48□□□□□ -1.37
MSH5Q12175 HGH1YGR187C 1185 nt6.48□□□□□ -1.37
MSH5Q12175 CCW12YLR110C 402 nt6.48□□□□□ -1.37
MSH5Q12175 VHT1YGR065C 1782 nt6.48□□□□□ -1.37
MSH5Q12175 RMD9YGL107C 1941 nt6.48□□□□□ -1.37
MSH5Q12175 NCA3YJL116C 1014 nt6.47□□□□□ -1.37
MSH5Q12175 SDH8YBR269C 417 nt6.47□□□□□ -1.37
MSH5Q12175 PMT3YOR321W 2262 nt6.46□□□□□ -1.37
MSH5Q12175 YCR049CYCR049C 447 nt6.46□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 COX9YDL067C 180 nt6.46□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 THI4YGR144W 981 nt6.46□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 YJL160CYJL160C 864 nt6.46□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 FRE5YOR384W 2085 nt6.46□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 GPI11YDR302W 660 nt6.45□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 OAC1YKL120W 975 nt6.45□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 MFT1YML062C 1179 nt6.45□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 HXK2YGL253W 1461 nt6.45□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 ESC8YOL017W 2145 nt6.44□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 URH1YDR400W 1023 nt6.44□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 DMC1YER179W 1005 nt6.44□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 SPR1YOR190W 1338 nt6.43□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 HEM1YDR232W 1647 nt6.43□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 FET4YMR319C 1659 nt6.42□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 OSM1YJR051W 1506 nt6.42□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 UTR5YEL035C 501 nt6.42□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 YPT1YFL038C 621 nt6.42□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 BRN1YBL097W 2265 nt6.42□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 YDR387CYDR387C 1668 nt6.42□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 CRP1YHR146W 1398 nt6.42□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 YDR514CYDR514C 1452 nt6.41□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 YKR023WYKR023W 1593 nt6.41□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 RAD51YER095W 1203 nt6.41□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 YJL213WYJL213W 996 nt6.41□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 IRC11YOR013W 471 nt6.41□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 ERV2YPR037C 591 nt6.41□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 PAB1YER165W 1734 nt6.41□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 UTR2YEL040W 1404 nt6.41□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 GYP8YFL027C 1494 nt6.41□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 AFG1YEL052W 1530 nt6.4□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 YDL177CYDL177C 513 nt6.4□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 MOD5YOR274W 1287 nt6.4□□□□□ -1.38
MSH5Q12175 HAS1YMR290C 1518 nt6.4□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 PNS1YOR161C 1620 nt6.39□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 SGV1YPR161C 1974 nt6.39□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 STS1YIR011C 960 nt6.39□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 DPM1YPR183W 804 nt6.39□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 STB5YHR178W 2232 nt6.38□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 NMT1YLR195C 1368 nt6.37□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 CBR1YIL043C 855 nt6.37□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 TDH1YJL052W 999 nt6.37□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 YML133CYML133C 4125 nt6.37□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.36□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.36□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.36□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.36□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.36□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.36□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.36□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.36□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.36□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.36□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.36□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.36□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.36□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.36□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.36□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.36□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 FBA1YKL060C 1080 nt6.36□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 CCP1YKR066C 1086 nt6.36□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 PXL1YKR090W 2121 nt6.36□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 PSP2YML017W 1782 nt6.36□□□□□ -1.39
MSH5Q12175 MTC5YDR128W 3447 nt6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.2 ms