Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VIK1Q12045 CIT2YCR005C 1383 nt6.7□□□□□ -1.34
VIK1Q12045 GDH1YOR375C 1365 nt6.7□□□□□ -1.34
VIK1Q12045 VBA5YKR105C 1749 nt6.7□□□□□ -1.34
VIK1Q12045 TOS1YBR162C 1368 nt6.69□□□□□ -1.34
VIK1Q12045 MSG5YNL053W 1470 nt6.69□□□□□ -1.34
VIK1Q12045 YIL055CYIL055C 1884 nt6.68□□□□□ -1.34
VIK1Q12045 YGL081WYGL081W 963 nt6.68□□□□□ -1.34
VIK1Q12045 DYS1YHR068W 1164 nt6.68□□□□□ -1.34
VIK1Q12045 CUE4YML101C 354 nt6.68□□□□□ -1.34
VIK1Q12045 DPM1YPR183W 804 nt6.68□□□□□ -1.34
VIK1Q12045 MSI1YBR195C 1269 nt6.68□□□□□ -1.34
VIK1Q12045 SLA2YNL243W 2907 nt6.68□□□□□ -1.34
VIK1Q12045 RIO1YOR119C 1455 nt6.67□□□□□ -1.34
VIK1Q12045 TUF1YOR187W 1314 nt6.67□□□□□ -1.34
VIK1Q12045 RGD2YFL047W 2145 nt6.67□□□□□ -1.34
VIK1Q12045 NMA2YGR010W 1188 nt6.66□□□□□ -1.34
VIK1Q12045 PAM17YKR065C 594 nt6.66□□□□□ -1.34
VIK1Q12045 PEX31YGR004W 1389 nt6.66□□□□□ -1.34
VIK1Q12045 CTA1YDR256C 1548 nt6.66□□□□□ -1.34
VIK1Q12045 YPL247CYPL247C 1572 nt6.65□□□□□ -1.34
VIK1Q12045 YDR476CYDR476C 675 nt6.65□□□□□ -1.34
VIK1Q12045 DMC1YER179W 1005 nt6.65□□□□□ -1.34
VIK1Q12045 YJR154WYJR154W 1041 nt6.65□□□□□ -1.34
VIK1Q12045 ADE1YAR015W 921 nt6.65□□□□□ -1.34
VIK1Q12045 ADH5YBR145W 1056 nt6.65□□□□□ -1.34
VIK1Q12045 GYP8YFL027C 1494 nt6.65□□□□□ -1.35
VIK1Q12045 PAC2YER007W 1557 nt6.65□□□□□ -1.35
VIK1Q12045 RAP1YNL216W 2484 nt6.65□□□□□ -1.35
VIK1Q12045 FET4YMR319C 1659 nt6.65□□□□□ -1.35
VIK1Q12045 HPT1YDR399W 666 nt6.64□□□□□ -1.35
VIK1Q12045 GCN3YKR026C 918 nt6.64□□□□□ -1.35
VIK1Q12045 MRP1YDR347W 966 nt6.63□□□□□ -1.35
VIK1Q12045 RBS1YDL189W 1374 nt6.61□□□□□ -1.35
VIK1Q12045 YCR049CYCR049C 447 nt6.61□□□□□ -1.35
VIK1Q12045 YML122CYML122C 381 nt6.61□□□□□ -1.35
VIK1Q12045 SES1YDR023W 1389 nt6.6□□□□□ -1.35
VIK1Q12045 ARG81YML099C 2643 nt6.6□□□□□ -1.35
VIK1Q12045 NCA3YJL116C 1014 nt6.6□□□□□ -1.35
VIK1Q12045 YJR107WYJR107W 987 nt6.6□□□□□ -1.35
VIK1Q12045 RTC4YNL254C 1206 nt6.6□□□□□ -1.35
VIK1Q12045 NAF1YNL124W 1479 nt6.6□□□□□ -1.35
VIK1Q12045 HIS1YER055C 894 nt6.59□□□□□ -1.35
VIK1Q12045 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.59□□□□□ -1.35
VIK1Q12045 CIS3YJL158C 684 nt6.59□□□□□ -1.35
VIK1Q12045 GEF1YJR040W 2340 nt6.58□□□□□ -1.36
VIK1Q12045 YPR204WYPR204W 3099 nt6.58□□□□□ -1.36
VIK1Q12045 YPQ2YDR352W 954 nt6.58□□□□□ -1.36
VIK1Q12045 IMA5YJL216C 1746 nt6.58□□□□□ -1.36
VIK1Q12045 ERP2YAL007C 648 nt6.57□□□□□ -1.36
VIK1Q12045 YKR032WYKR032W 315 nt6.57□□□□□ -1.36
VIK1Q12045 MPE1YKL059C 1326 nt6.56□□□□□ -1.36
VIK1Q12045 NFS1YCL017C 1494 nt6.56□□□□□ -1.36
VIK1Q12045 PPM1YDR435C 987 nt6.56□□□□□ -1.36
VIK1Q12045 TUB1YML085C 1344 nt6.55□□□□□ -1.36
VIK1Q12045 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.55□□□□□ -1.36
VIK1Q12045 PEX13YLR191W 1161 nt6.55□□□□□ -1.36
VIK1Q12045 COX5AYNL052W 462 nt6.55□□□□□ -1.36
VIK1Q12045 YBR284WYBR284W 2394 nt6.55□□□□□ -1.36
VIK1Q12045 TPO3YPR156C 1869 nt6.54□□□□□ -1.36
VIK1Q12045 snR82snR82 268 nt6.54□□□□□ -1.36
VIK1Q12045 ICS3YJL077C 396 nt6.54□□□□□ -1.36
VIK1Q12045 YBL070CYBL070C 321 nt6.54□□□□□ -1.36
VIK1Q12045 ATP23YNR020C 813 nt6.54□□□□□ -1.36
VIK1Q12045 TRS31YDR472W 852 nt6.53□□□□□ -1.36
VIK1Q12045 DOC1YGL240W 753 nt6.53□□□□□ -1.36
VIK1Q12045 YIA6YIL006W 1122 nt6.53□□□□□ -1.36
VIK1Q12045 YOR300WYOR300W 309 nt6.53□□□□□ -1.36
VIK1Q12045 MKK1YOR231W 1527 nt6.53□□□□□ -1.36
VIK1Q12045 ACS1YAL054C 2142 nt6.53□□□□□ -1.36
VIK1Q12045 MPA43YNL249C 1629 nt6.52□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 FRE5YOR384W 2085 nt6.52□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 YDR415CYDR415C 1125 nt6.51□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 TOS6YNL300W 309 nt6.51□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 CYC8YBR112C 2901 nt6.51□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 LAG2YOL025W 1983 nt6.51□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 KEL1YHR158C 3495 nt6.51□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 POP1YNL221C 2628 nt6.5□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 NMT1YLR195C 1368 nt6.5□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 YHC3YJL059W 1227 nt6.5□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 YML6YML025C 861 nt6.5□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 FUS3YBL016W 1062 nt6.5□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 EFT2YDR385W 2529 nt6.5□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 EFT1YOR133W 2529 nt6.5□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 SGV1YPR161C 1974 nt6.49□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt6.49□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt6.49□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt6.49□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 SUP51tL(UAA)J 84 nt6.49□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt6.49□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt6.49□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt6.49□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 DUS4YLR405W 1104 nt6.49□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 RSA4YCR072C 1548 nt6.49□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 PLB2YMR006C 2121 nt6.49□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 RGD1YBR260C 2001 nt6.49□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 SLX5YDL013W 1860 nt6.48□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 SKI2YLR398C 3864 nt6.48□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 DML1YMR211W 1428 nt6.48□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 YMR034CYMR034C 1305 nt6.48□□□□□ -1.37
VIK1Q12045 HXT15YDL245C 1704 nt6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.1 ms