Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCNQ0VAF6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYCNQ0VAF6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms