Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK18Q07002 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK18Q07002 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK18Q07002 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK18Q07002 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK18Q07002 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK18Q07002 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK18Q07002 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK18Q07002 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK18Q07002 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK18Q07002 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK18Q07002 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK18Q07002 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK18Q07002 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK18Q07002 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK18Q07002 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK18Q07002 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK18Q07002 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK18Q07002 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK18Q07002 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK18Q07002 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK18Q07002 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK18Q07002 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK18Q07002 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK18Q07002 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK18Q07002 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK18Q07002 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK18Q07002 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK18Q07002 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK18Q07002 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms