Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAX8Q06710 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX8Q06710 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms