Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDSRQ06136 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDSRQ06136 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDSRQ06136 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms