Protein–RNA interactions for Protein: Q05919

VPS38, Vacuolar protein sorting-associated protein 38, yeastyeast

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS38Q05919 MGM101YJR144W 810 nt7.41□□□□□ -1.22
VPS38Q05919 OPI8YKR035C 642 nt7.41□□□□□ -1.22
VPS38Q05919 BUD20YLR074C 501 nt7.41□□□□□ -1.22
VPS38Q05919 GUT1YHL032C 2130 nt7.4□□□□□ -1.22
VPS38Q05919 RPL31BYLR406C 342 nt7.4□□□□□ -1.22
VPS38Q05919 SPG5YMR191W 1122 nt7.4□□□□□ -1.22
VPS38Q05919 ECM38YLR299W 1983 nt7.39□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 VBA5YKR105C 1749 nt7.39□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 PEX31YGR004W 1389 nt7.39□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 HOG1YLR113W 1308 nt7.39□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 CIA1YDR267C 993 nt7.39□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 HSP12YFL014W 330 nt7.39□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 DYS1YHR068W 1164 nt7.39□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 TRR2YHR106W 1029 nt7.39□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 YNR005CYNR005C 405 nt7.39□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 YPQ1YOL092W 927 nt7.39□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 NAF1YNL124W 1479 nt7.38□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 YIP4YGL198W 708 nt7.38□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 PTH2YBL057C 627 nt7.38□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 MBF1YOR298C-A 456 nt7.38□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 EDC3YEL015W 1656 nt7.38□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 BDF2YDL070W 1917 nt7.37□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 YDL177CYDL177C 513 nt7.37□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 PTC7YHR076W 1032 nt7.37□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 HTZ1YOL012C 405 nt7.37□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 snR30snR30 606 nt7.37□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 ECM27YJR106W 2178 nt7.36□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 CYS3YAL012W 1185 nt7.36□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 YCL049CYCL049C 939 nt7.36□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 FCY22YER060W-A 1593 nt7.36□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 GCN3YKR026C 918 nt7.35□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 SUR7YML052W 909 nt7.35□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 PRS4YBL068W 981 nt7.35□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 MIP1YOR330C 3765 nt7.35□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 ARP3YJR065C 1350 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 MRPS28YDR337W 861 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 YSC83YHR017W 1158 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 CTF8YHR191C 402 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 IRC11YOR013W 471 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 YLL058WYLL058W 1728 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS38Q05919 YMR034CYMR034C 1305 nt7.32□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 APE4YHR113W 1473 nt7.32□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 YJR107WYJR107W 987 nt7.32□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 TOS6YNL300W 309 nt7.32□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 ADH5YBR145W 1056 nt7.32□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 CCR4YAL021C 2514 nt7.31□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 HIS1YER055C 894 nt7.31□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 YGL102CYGL102C 429 nt7.31□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 YJL144WYJL144W 315 nt7.31□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 YML079WYML079W 606 nt7.31□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 CST26YBR042C 1194 nt7.31□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 YHR131CYHR131C 2553 nt7.31□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 EDC2YER035W 438 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 CUE4YML101C 354 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 SMX3YPR182W 261 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 RSP5YER125W 2430 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 YHR020WYHR020W 2067 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 YDR415CYDR415C 1125 nt7.28□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 PRI1YIR008C 1230 nt7.28□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 YLR162WYLR162W 357 nt7.28□□□□□ -1.24
VPS38Q05919 SEC62YPL094C 825 nt7.27□□□□□ -1.25
VPS38Q05919 HEM1YDR232W 1647 nt7.27□□□□□ -1.25
VPS38Q05919 ICP55YER078C 1536 nt7.27□□□□□ -1.25
VPS38Q05919 STT3YGL022W 2157 nt7.26□□□□□ -1.25
VPS38Q05919 YKR032WYKR032W 315 nt7.26□□□□□ -1.25
VPS38Q05919 PPM2YOL141W 2088 nt7.26□□□□□ -1.25
VPS38Q05919 YPT1YFL038C 621 nt7.25□□□□□ -1.25
VPS38Q05919 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt7.25□□□□□ -1.25
VPS38Q05919 SKY1YMR216C 2229 nt7.25□□□□□ -1.25
VPS38Q05919 HED1YDR014W-A 489 nt7.24□□□□□ -1.25
VPS38Q05919 MSC3YLR219W 2187 nt7.24□□□□□ -1.25
VPS38Q05919 PUP2YGR253C 783 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS38Q05919 YLL056CYLL056C 897 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS38Q05919 ERG10YPL028W 1197 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS38Q05919 YPR204WYPR204W 3099 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS38Q05919 CLN1YMR199W 1641 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS38Q05919 ATG36YJL185C 882 nt7.22□□□□□ -1.25
VPS38Q05919 TMA46YOR091W 1038 nt7.22□□□□□ -1.25
VPS38Q05919 AGP2YBR132C 1791 nt7.22□□□□□ -1.25
VPS38Q05919 MRPL19YNL185C 477 nt7.21□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 EDE1YBL047C 4146 nt7.21□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 SES1YDR023W 1389 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 COQ1YBR003W 1422 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 PMT3YOR321W 2262 nt7.2□□□□□ -1.26
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