Protein–RNA interactions for Protein: Q04006

UPS3, Protein UPS3, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPS3Q04006 MIX17YMR002W 471 nt5.5□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 SLA2YNL243W 2907 nt5.49□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 MRPL28YDR462W 444 nt5.49□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 PIL1YGR086C 1020 nt5.49□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 COX16YJL003W 357 nt5.49□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 TAD2YJL035C 753 nt5.49□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 PAM17YKR065C 594 nt5.49□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 HRB1YNL004W 1365 nt5.49□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 DLD1YDL174C 1764 nt5.48□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 HAC1YFL031W 717 nt5.48□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 ESC8YOL017W 2145 nt5.48□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 CEM1YER061C 1329 nt5.48□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 YPR204WYPR204W 3099 nt5.47□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 PGI1YBR196C 1665 nt5.47□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 CIT2YCR005C 1383 nt5.47□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 ELP4YPL101W 1371 nt5.47□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 THR1YHR025W 1074 nt5.47□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 YJR142WYJR142W 1029 nt5.47□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 RDN5-2RDN5-2 119 nt5.47□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 RDN5-3RDN5-3 119 nt5.47□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 RDN5-4RDN5-4 119 nt5.47□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 PEX13YLR191W 1161 nt5.47□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 RDN5-5RDN5-5 119 nt5.47□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 IMA5YJL216C 1746 nt5.47□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 PAT1YCR077C 2391 nt5.47□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 PPM1YDR435C 987 nt5.46□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 YDR476CYDR476C 675 nt5.46□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 YGL081WYGL081W 963 nt5.46□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 PUP1YOR157C 786 nt5.46□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 GPA1YHR005C 1419 nt5.46□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 NUP53YMR153W 1428 nt5.46□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 YDR387CYDR387C 1668 nt5.46□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 GDH1YOR375C 1365 nt5.45□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 SKN1YGR143W 2316 nt5.45□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 MLS1YNL117W 1665 nt5.45□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 NCA3YJL116C 1014 nt5.45□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 RPL5YPL131W 894 nt5.45□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 LDB19YOR322C 2457 nt5.45□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 QNS1YHR074W 2145 nt5.44□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 ERG27YLR100W 1044 nt5.44□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 SLG1YOR008C 1137 nt5.44□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 DPM1YPR183W 804 nt5.44□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 MSI1YBR195C 1269 nt5.44□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 LSG1YGL099W 1923 nt5.44□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 BZZ1YHR114W 1902 nt5.44□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 YML6YML025C 861 nt5.43□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 YEL020CYEL020C 1683 nt5.43□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 TPO3YPR156C 1869 nt5.43□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 PPH22YDL188C 1134 nt5.42□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 YIL077CYIL077C 963 nt5.42□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 AIM33YML087C 939 nt5.42□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 GYP8YFL027C 1494 nt5.42□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 SAC6YDR129C 1929 nt5.41□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 MSG5YNL053W 1470 nt5.41□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 YPQ2YDR352W 954 nt5.41□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 YOL099CYOL099C 492 nt5.41□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 TUB1YML085C 1344 nt5.41□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 KEL1YHR158C 3495 nt5.4□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 MRP1YDR347W 966 nt5.4□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 YJL144WYJL144W 315 nt5.4□□□□□ -1.54
UPS3Q04006 YPL247CYPL247C 1572 nt5.4□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 NMA2YGR010W 1188 nt5.39□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 CUE4YML101C 354 nt5.39□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 YML122CYML122C 381 nt5.39□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 TUF1YOR187W 1314 nt5.39□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 HXT15YDL245C 1704 nt5.38□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 HXT16YJR158W 1704 nt5.38□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 HPT1YDR399W 666 nt5.38□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 DYS1YHR068W 1164 nt5.38□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 HSP150YJL159W 1242 nt5.38□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 OAC1YKL120W 975 nt5.38□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 MPE1YKL059C 1326 nt5.38□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 HAS1YMR290C 1518 nt5.38□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 ADE1YAR015W 921 nt5.37□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 CTA1YDR256C 1548 nt5.36□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 AFG1YEL052W 1530 nt5.36□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 FET4YMR319C 1659 nt5.36□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 MTC5YDR128W 3447 nt5.36□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 STE13YOR219C 2796 nt5.35□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 PAC2YER007W 1557 nt5.35□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 YCR049CYCR049C 447 nt5.35□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 GCN3YKR026C 918 nt5.35□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 DUS4YLR405W 1104 nt5.35□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 RTC4YNL254C 1206 nt5.35□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 STB5YHR178W 2232 nt5.35□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 NFS1YCL017C 1494 nt5.34□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 PEX31YGR004W 1389 nt5.34□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 ICS3YJL077C 396 nt5.34□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 ADH5YBR145W 1056 nt5.34□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 Q0010Q0010 387 nt5.34□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 NTE1YML059C 5040 nt5.34□□□□□ -1.55
UPS3Q04006 MKK1YOR231W 1527 nt5.33□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 RGD2YFL047W 2145 nt5.33□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 YDR514CYDR514C 1452 nt5.33□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 LAT1YNL071W 1449 nt5.33□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 DMC1YER179W 1005 nt5.33□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 YIA6YIL006W 1122 nt5.33□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 YMR279CYMR279C 1623 nt5.33□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 YMR034CYMR034C 1305 nt5.32□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 HIS1YER055C 894 nt5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.9 ms