Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDKL1Q00532 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDKL1Q00532 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms