Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP9P55211 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP9P55211 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP9P55211 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP9P55211 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP9P55211 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP9P55211 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP9P55211 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP9P55211 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP9P55211 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP9P55211 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP9P55211 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP9P55211 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP9P55211 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP9P55211 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP9P55211 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP9P55211 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP9P55211 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP9P55211 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP9P55211 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP9P55211 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP9P55211 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP9P55211 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP9P55211 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP9P55211 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP9P55211 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP9P55211 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP9P55211 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP9P55211 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP9P55211 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP9P55211 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP9P55211 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP9P55211 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP9P55211 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP9P55211 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP9P55211 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP9P55211 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP9P55211 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP9P55211 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP9P55211 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP9P55211 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP9P55211 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP9P55211 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP9P55211 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP9P55211 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP9P55211 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP9P55211 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP9P55211 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP9P55211 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP9P55211 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP9P55211 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP9P55211 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP9P55211 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASP9P55211 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASP9P55211 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASP9P55211 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP9P55211 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP9P55211 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP9P55211 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP9P55211 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP9P55211 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP9P55211 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP9P55211 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP9P55211 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP9P55211 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP9P55211 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP9P55211 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP9P55211 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP9P55211 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP9P55211 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP9P55211 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP9P55211 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP9P55211 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP9P55211 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP9P55211 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP9P55211 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP9P55211 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP9P55211 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP9P55211 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP9P55211 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP9P55211 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP9P55211 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP9P55211 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP9P55211 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP9P55211 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP9P55211 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP9P55211 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP9P55211 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASP9P55211 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP9P55211 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP9P55211 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP9P55211 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP9P55211 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP9P55211 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP9P55211 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP9P55211 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP9P55211 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP9P55211 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP9P55211 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP9P55211 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms