Protein–RNA interactions for Protein: P51946

CCNH, Cyclin-H, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNHP51946 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNHP51946 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNHP51946 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNHP51946 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNHP51946 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNHP51946 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNHP51946 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNHP51946 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNHP51946 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNHP51946 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNHP51946 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNHP51946 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNHP51946 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCNHP51946 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCNHP51946 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCNHP51946 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNHP51946 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNHP51946 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNHP51946 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNHP51946 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNHP51946 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNHP51946 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNHP51946 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNHP51946 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNHP51946 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNHP51946 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNHP51946 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNHP51946 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNHP51946 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNHP51946 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNHP51946 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNHP51946 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNHP51946 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNHP51946 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNHP51946 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNHP51946 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNHP51946 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNHP51946 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNHP51946 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNHP51946 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNHP51946 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNHP51946 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNHP51946 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNHP51946 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNHP51946 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNHP51946 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNHP51946 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNHP51946 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNHP51946 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNHP51946 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNHP51946 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNHP51946 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNHP51946 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNHP51946 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNHP51946 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNHP51946 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNHP51946 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNHP51946 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNHP51946 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNHP51946 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNHP51946 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNHP51946 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNHP51946 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNHP51946 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNHP51946 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNHP51946 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNHP51946 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNHP51946 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNHP51946 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNHP51946 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNHP51946 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNHP51946 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNHP51946 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNHP51946 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNHP51946 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNHP51946 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNHP51946 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNHP51946 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNHP51946 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNHP51946 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNHP51946 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNHP51946 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNHP51946 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNHP51946 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNHP51946 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNHP51946 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNHP51946 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNHP51946 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNHP51946 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNHP51946 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNHP51946 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNHP51946 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNHP51946 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNHP51946 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNHP51946 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNHP51946 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNHP51946 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNHP51946 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNHP51946 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNHP51946 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms