Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP3P42574 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP3P42574 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP3P42574 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP3P42574 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP3P42574 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP3P42574 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP3P42574 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP3P42574 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP3P42574 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP3P42574 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP3P42574 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP3P42574 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP3P42574 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP3P42574 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP3P42574 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP3P42574 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP3P42574 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP3P42574 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP3P42574 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP3P42574 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP3P42574 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP3P42574 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP3P42574 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP3P42574 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP3P42574 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP3P42574 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP3P42574 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP3P42574 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP3P42574 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP3P42574 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP3P42574 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP3P42574 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP3P42574 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP3P42574 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP3P42574 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP3P42574 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP3P42574 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP3P42574 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP3P42574 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP3P42574 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP3P42574 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP3P42574 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP3P42574 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP3P42574 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP3P42574 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP3P42574 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP3P42574 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP3P42574 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP3P42574 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP3P42574 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP3P42574 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP3P42574 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP3P42574 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP3P42574 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP3P42574 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP3P42574 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP3P42574 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP3P42574 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP3P42574 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP3P42574 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP3P42574 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP3P42574 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP3P42574 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP3P42574 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP3P42574 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP3P42574 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP3P42574 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP3P42574 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP3P42574 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP3P42574 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP3P42574 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP3P42574 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP3P42574 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP3P42574 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP3P42574 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP3P42574 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP3P42574 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP3P42574 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP3P42574 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP3P42574 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP3P42574 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP3P42574 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP3P42574 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP3P42574 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP3P42574 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP3P42574 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP3P42574 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP3P42574 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP3P42574 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP3P42574 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP3P42574 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP3P42574 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP3P42574 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP3P42574 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP3P42574 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP3P42574 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP3P42574 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP3P42574 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP3P42574 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms