Protein–RNA interactions for Protein: P40003

VAB2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit VAB2, yeastyeast

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAB2P40003 CUP2YGL166W 678 nt7.56□□□□□ -1.2
VAB2P40003 UIP5YKR044W 1332 nt7.55□□□□□ -1.2
VAB2P40003 SWD1YAR003W 1281 nt7.55□□□□□ -1.2
VAB2P40003 ZWF1YNL241C 1518 nt7.54□□□□□ -1.2
VAB2P40003 MHP1YJL042W 4197 nt7.54□□□□□ -1.2
VAB2P40003 MSP1YGR028W 1089 nt7.54□□□□□ -1.2
VAB2P40003 REC107YJR021C 945 nt7.54□□□□□ -1.2
VAB2P40003 MRPL10YNL284C 969 nt7.54□□□□□ -1.2
VAB2P40003 MDH2YOL126C 1134 nt7.54□□□□□ -1.2
VAB2P40003 YBL113CYBL113C 2379 nt7.53□□□□□ -1.2
VAB2P40003 THR1YHR025W 1074 nt7.53□□□□□ -1.2
VAB2P40003 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt7.53□□□□□ -1.2
VAB2P40003 MRPS28YDR337W 861 nt7.52□□□□□ -1.21
VAB2P40003 GTS1YGL181W 1191 nt7.52□□□□□ -1.21
VAB2P40003 YKR045CYKR045C 552 nt7.52□□□□□ -1.21
VAB2P40003 LIP5YOR196C 1245 nt7.52□□□□□ -1.21
VAB2P40003 PEX3YDR329C 1326 nt7.52□□□□□ -1.21
VAB2P40003 FPR3YML074C 1236 nt7.51□□□□□ -1.21
VAB2P40003 YDR306CYDR306C 1437 nt7.51□□□□□ -1.21
VAB2P40003 PMT7YDR307W 1989 nt7.5□□□□□ -1.21
VAB2P40003 UFD1YGR048W 1086 nt7.5□□□□□ -1.21
VAB2P40003 RPS28AYOR167C 204 nt7.5□□□□□ -1.21
VAB2P40003 HPT1YDR399W 666 nt7.49□□□□□ -1.21
VAB2P40003 YKL077WYKL077W 1179 nt7.49□□□□□ -1.21
VAB2P40003 SPG5YMR191W 1122 nt7.49□□□□□ -1.21
VAB2P40003 SGF73YGL066W 1974 nt7.48□□□□□ -1.21
VAB2P40003 YHK8YHR048W 1545 nt7.47□□□□□ -1.21
VAB2P40003 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.47□□□□□ -1.21
VAB2P40003 YRB2YIL063C 984 nt7.47□□□□□ -1.21
VAB2P40003 TMA46YOR091W 1038 nt7.47□□□□□ -1.21
VAB2P40003 SEC62YPL094C 825 nt7.47□□□□□ -1.21
VAB2P40003 ADH5YBR145W 1056 nt7.47□□□□□ -1.21
VAB2P40003 HED1YDR014W-A 489 nt7.46□□□□□ -1.22
VAB2P40003 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt7.46□□□□□ -1.22
VAB2P40003 YAR064WYAR064W 300 nt7.46□□□□□ -1.22
VAB2P40003 PFS2YNL317W 1398 nt7.46□□□□□ -1.22
VAB2P40003 YPR127WYPR127W 1038 nt7.45□□□□□ -1.22
VAB2P40003 MSS51YLR203C 1311 nt7.45□□□□□ -1.22
VAB2P40003 CTA1YDR256C 1548 nt7.44□□□□□ -1.22
VAB2P40003 GNA1YFL017C 480 nt7.44□□□□□ -1.22
VAB2P40003 ZRT2YLR130C 1269 nt7.44□□□□□ -1.22
VAB2P40003 PHO85YPL031C 918 nt7.44□□□□□ -1.22
VAB2P40003 UIP4YPL186C 915 nt7.44□□□□□ -1.22
VAB2P40003 BEM1YBR200W 1656 nt7.43□□□□□ -1.22
VAB2P40003 YMR034CYMR034C 1305 nt7.43□□□□□ -1.22
VAB2P40003 DSF1YEL070W 1509 nt7.42□□□□□ -1.22
VAB2P40003 YNR073CYNR073C 1509 nt7.42□□□□□ -1.22
VAB2P40003 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.42□□□□□ -1.22
VAB2P40003 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.42□□□□□ -1.22
VAB2P40003 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.42□□□□□ -1.22
VAB2P40003 TIM22YDL217C 624 nt7.42□□□□□ -1.22
VAB2P40003 TIF2YJL138C 1188 nt7.42□□□□□ -1.22
VAB2P40003 TIF1YKR059W 1188 nt7.42□□□□□ -1.22
VAB2P40003 RPL31BYLR406C 342 nt7.42□□□□□ -1.22
VAB2P40003 MRPL23YOR150W 492 nt7.42□□□□□ -1.22
VAB2P40003 HSV2YGR223C 1347 nt7.42□□□□□ -1.22
VAB2P40003 YEL023CYEL023C 2049 nt7.42□□□□□ -1.22
VAB2P40003 DLD1YDL174C 1764 nt7.41□□□□□ -1.22
VAB2P40003 MPC2YHR162W 390 nt7.41□□□□□ -1.22
VAB2P40003 PPH22YDL188C 1134 nt7.4□□□□□ -1.22
VAB2P40003 MOG1YJR074W 657 nt7.4□□□□□ -1.22
VAB2P40003 YMR279CYMR279C 1623 nt7.4□□□□□ -1.22
VAB2P40003 DOT1YDR440W 1749 nt7.4□□□□□ -1.23
VAB2P40003 SEN34YAR008W 828 nt7.39□□□□□ -1.23
VAB2P40003 HVG1YER039C 750 nt7.38□□□□□ -1.23
VAB2P40003 IVY1YDR229W 1362 nt7.37□□□□□ -1.23
VAB2P40003 CCT8YJL008C 1707 nt7.37□□□□□ -1.23
VAB2P40003 MET30YIL046W 1923 nt7.37□□□□□ -1.23
VAB2P40003 FCP1YMR277W 2199 nt7.36□□□□□ -1.23
VAB2P40003 LYS21YDL131W 1323 nt7.36□□□□□ -1.23
VAB2P40003 YOR041CYOR041C 432 nt7.36□□□□□ -1.23
VAB2P40003 ERG1YGR175C 1491 nt7.36□□□□□ -1.23
VAB2P40003 MSG5YNL053W 1470 nt7.36□□□□□ -1.23
VAB2P40003 COX10YPL172C 1389 nt7.35□□□□□ -1.23
VAB2P40003 NDE1YMR145C 1683 nt7.35□□□□□ -1.23
VAB2P40003 YDL144CYDL144C 1071 nt7.35□□□□□ -1.23
VAB2P40003 CTF19YPL018W 1110 nt7.35□□□□□ -1.23
VAB2P40003 EMP65YER140W 1671 nt7.35□□□□□ -1.23
VAB2P40003 MIX17YMR002W 471 nt7.34□□□□□ -1.23
VAB2P40003 NAS6YGR232W 687 nt7.33□□□□□ -1.24
VAB2P40003 YPR196WYPR196W 1413 nt7.33□□□□□ -1.24
VAB2P40003 CDC23YHR166C 1881 nt7.32□□□□□ -1.24
VAB2P40003 MAL31YBR298C 1845 nt7.32□□□□□ -1.24
VAB2P40003 SGF29YCL010C 780 nt7.32□□□□□ -1.24
VAB2P40003 STF1YDL130W-A 261 nt7.31□□□□□ -1.24
VAB2P40003 VPS24YKL041W 675 nt7.31□□□□□ -1.24
VAB2P40003 SNN1YNL086W 309 nt7.31□□□□□ -1.24
VAB2P40003 YNL190WYNL190W 615 nt7.31□□□□□ -1.24
VAB2P40003 IRC5YFR038W 2562 nt7.31□□□□□ -1.24
VAB2P40003 PPM2YOL141W 2088 nt7.31□□□□□ -1.24
VAB2P40003 CCR4YAL021C 2514 nt7.3□□□□□ -1.24
VAB2P40003 COQ1YBR003W 1422 nt7.3□□□□□ -1.24
VAB2P40003 TSR3YOR006C 942 nt7.3□□□□□ -1.24
VAB2P40003 MLS1YNL117W 1665 nt7.3□□□□□ -1.24
VAB2P40003 NUP57YGR119C 1626 nt7.3□□□□□ -1.24
VAB2P40003 YDL172CYDL172C 480 nt7.29□□□□□ -1.24
VAB2P40003 YHL018WYHL018W 363 nt7.29□□□□□ -1.24
VAB2P40003 ERP5YHR110W 639 nt7.29□□□□□ -1.24
VAB2P40003 ATP10YLR393W 840 nt7.29□□□□□ -1.24
VAB2P40003 YHR020WYHR020W 2067 nt7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.7 ms