Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPRR1AP35321 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPRR1AP35321 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms