Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GBP1P32455 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GBP1P32455 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GBP1P32455 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GBP1P32455 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GBP1P32455 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GBP1P32455 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GBP1P32455 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GBP1P32455 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GBP1P32455 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GBP1P32455 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GBP1P32455 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GBP1P32455 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GBP1P32455 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GBP1P32455 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP1P32455 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP1P32455 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP1P32455 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP1P32455 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GBP1P32455 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GBP1P32455 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GBP1P32455 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GBP1P32455 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP1P32455 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP1P32455 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP1P32455 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP1P32455 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP1P32455 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP1P32455 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP1P32455 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GBP1P32455 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GBP1P32455 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GBP1P32455 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBP1P32455 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBP1P32455 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBP1P32455 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBP1P32455 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBP1P32455 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GBP1P32455 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBP1P32455 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GBP1P32455 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP1P32455 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP1P32455 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP1P32455 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP1P32455 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP1P32455 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP1P32455 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP1P32455 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GBP1P32455 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GBP1P32455 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GBP1P32455 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GBP1P32455 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GBP1P32455 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GBP1P32455 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GBP1P32455 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GBP1P32455 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GBP1P32455 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GBP1P32455 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GBP1P32455 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GBP1P32455 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GBP1P32455 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GBP1P32455 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GBP1P32455 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GBP1P32455 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP1P32455 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP1P32455 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP1P32455 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP1P32455 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP1P32455 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP1P32455 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP1P32455 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP1P32455 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GBP1P32455 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GBP1P32455 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GBP1P32455 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GBP1P32455 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GBP1P32455 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP1P32455 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP1P32455 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP1P32455 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP1P32455 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP1P32455 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP1P32455 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP1P32455 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP1P32455 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP1P32455 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP1P32455 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP1P32455 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP1P32455 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP1P32455 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP1P32455 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP1P32455 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP1P32455 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP1P32455 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP1P32455 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP1P32455 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP1P32455 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP1P32455 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GBP1P32455 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GBP1P32455 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms