Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CD38P28907 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD38P28907 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD38P28907 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD38P28907 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD38P28907 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD38P28907 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD38P28907 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD38P28907 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CD38P28907 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD38P28907 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD38P28907 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD38P28907 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD38P28907 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD38P28907 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD38P28907 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD38P28907 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD38P28907 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD38P28907 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD38P28907 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD38P28907 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD38P28907 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD38P28907 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD38P28907 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD38P28907 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD38P28907 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD38P28907 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CD38P28907 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD38P28907 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CD38P28907 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD38P28907 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD38P28907 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD38P28907 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD38P28907 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CD38P28907 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CD38P28907 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD38P28907 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD38P28907 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD38P28907 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD38P28907 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD38P28907 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD38P28907 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD38P28907 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD38P28907 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD38P28907 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD38P28907 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD38P28907 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD38P28907 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD38P28907 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CD38P28907 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD38P28907 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD38P28907 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD38P28907 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CD38P28907 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD38P28907 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD38P28907 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD38P28907 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CD38P28907 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD38P28907 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD38P28907 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD38P28907 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD38P28907 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CD38P28907 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD38P28907 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CD38P28907 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD38P28907 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD38P28907 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD38P28907 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CD38P28907 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD38P28907 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD38P28907 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CD38P28907 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD38P28907 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD38P28907 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD38P28907 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD38P28907 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD38P28907 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD38P28907 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD38P28907 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD38P28907 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD38P28907 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD38P28907 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD38P28907 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD38P28907 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD38P28907 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD38P28907 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD38P28907 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD38P28907 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD38P28907 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD38P28907 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD38P28907 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD38P28907 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD38P28907 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD38P28907 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD38P28907 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD38P28907 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD38P28907 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CD38P28907 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CD38P28907 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD38P28907 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms