Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOT1P17174 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOT1P17174 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOT1P17174 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOT1P17174 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOT1P17174 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOT1P17174 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOT1P17174 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GOT1P17174 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOT1P17174 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOT1P17174 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOT1P17174 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOT1P17174 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOT1P17174 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOT1P17174 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOT1P17174 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOT1P17174 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOT1P17174 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GOT1P17174 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOT1P17174 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOT1P17174 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOT1P17174 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOT1P17174 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOT1P17174 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOT1P17174 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GOT1P17174 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOT1P17174 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOT1P17174 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOT1P17174 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOT1P17174 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOT1P17174 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOT1P17174 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOT1P17174 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOT1P17174 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOT1P17174 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GOT1P17174 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOT1P17174 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOT1P17174 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOT1P17174 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOT1P17174 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOT1P17174 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOT1P17174 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOT1P17174 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOT1P17174 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOT1P17174 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOT1P17174 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOT1P17174 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOT1P17174 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOT1P17174 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOT1P17174 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOT1P17174 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOT1P17174 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOT1P17174 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOT1P17174 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOT1P17174 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOT1P17174 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOT1P17174 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOT1P17174 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOT1P17174 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOT1P17174 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOT1P17174 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOT1P17174 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOT1P17174 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOT1P17174 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOT1P17174 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOT1P17174 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOT1P17174 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOT1P17174 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOT1P17174 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOT1P17174 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOT1P17174 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOT1P17174 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOT1P17174 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOT1P17174 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOT1P17174 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOT1P17174 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOT1P17174 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOT1P17174 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOT1P17174 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOT1P17174 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOT1P17174 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOT1P17174 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOT1P17174 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GOT1P17174 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOT1P17174 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOT1P17174 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GOT1P17174 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOT1P17174 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOT1P17174 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOT1P17174 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOT1P17174 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOT1P17174 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GOT1P17174 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GOT1P17174 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOT1P17174 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOT1P17174 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOT1P17174 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOT1P17174 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOT1P17174 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOT1P17174 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms