Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSN3P07498 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CSN3P07498 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSN3P07498 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSN3P07498 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSN3P07498 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSN3P07498 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSN3P07498 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CSN3P07498 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSN3P07498 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSN3P07498 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSN3P07498 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSN3P07498 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSN3P07498 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSN3P07498 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSN3P07498 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSN3P07498 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSN3P07498 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSN3P07498 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSN3P07498 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSN3P07498 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSN3P07498 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSN3P07498 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSN3P07498 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSN3P07498 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSN3P07498 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSN3P07498 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSN3P07498 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSN3P07498 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSN3P07498 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSN3P07498 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSN3P07498 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSN3P07498 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CSN3P07498 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSN3P07498 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSN3P07498 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSN3P07498 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSN3P07498 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSN3P07498 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSN3P07498 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSN3P07498 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSN3P07498 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSN3P07498 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSN3P07498 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSN3P07498 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSN3P07498 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSN3P07498 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CSN3P07498 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSN3P07498 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSN3P07498 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSN3P07498 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSN3P07498 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSN3P07498 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSN3P07498 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSN3P07498 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSN3P07498 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSN3P07498 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSN3P07498 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSN3P07498 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSN3P07498 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSN3P07498 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSN3P07498 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSN3P07498 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSN3P07498 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSN3P07498 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSN3P07498 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSN3P07498 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSN3P07498 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSN3P07498 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSN3P07498 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSN3P07498 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSN3P07498 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSN3P07498 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSN3P07498 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSN3P07498 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSN3P07498 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSN3P07498 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSN3P07498 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSN3P07498 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSN3P07498 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CSN3P07498 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSN3P07498 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSN3P07498 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSN3P07498 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSN3P07498 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSN3P07498 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSN3P07498 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSN3P07498 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSN3P07498 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSN3P07498 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSN3P07498 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSN3P07498 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSN3P07498 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSN3P07498 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSN3P07498 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSN3P07498 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSN3P07498 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSN3P07498 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSN3P07498 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSN3P07498 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms