Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC1P02654 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC1P02654 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC1P02654 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC1P02654 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC1P02654 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOC1P02654 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOC1P02654 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOC1P02654 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC1P02654 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC1P02654 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC1P02654 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC1P02654 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC1P02654 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC1P02654 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC1P02654 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC1P02654 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC1P02654 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC1P02654 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC1P02654 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC1P02654 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC1P02654 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC1P02654 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOC1P02654 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOC1P02654 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOC1P02654 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOC1P02654 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOC1P02654 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOC1P02654 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOC1P02654 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOC1P02654 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOC1P02654 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC1P02654 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC1P02654 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC1P02654 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC1P02654 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC1P02654 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC1P02654 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC1P02654 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOC1P02654 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
APOC1P02654 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOC1P02654 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOC1P02654 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOC1P02654 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOC1P02654 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOC1P02654 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOC1P02654 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOC1P02654 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC1P02654 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC1P02654 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC1P02654 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC1P02654 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC1P02654 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC1P02654 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC1P02654 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC1P02654 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC1P02654 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC1P02654 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOC1P02654 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOC1P02654 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOC1P02654 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOC1P02654 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOC1P02654 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOC1P02654 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOC1P02654 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOC1P02654 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOC1P02654 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOC1P02654 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOC1P02654 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOC1P02654 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOC1P02654 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
APOC1P02654 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOC1P02654 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOC1P02654 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOC1P02654 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOC1P02654 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOC1P02654 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOC1P02654 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOC1P02654 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOC1P02654 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOC1P02654 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOC1P02654 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOC1P02654 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOC1P02654 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOC1P02654 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
APOC1P02654 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOC1P02654 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOC1P02654 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOC1P02654 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOC1P02654 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOC1P02654 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOC1P02654 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOC1P02654 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOC1P02654 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOC1P02654 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOC1P02654 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOC1P02654 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOC1P02654 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC1P02654 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC1P02654 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms