Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRUB2O95900 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRUB2O95900 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRUB2O95900 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRUB2O95900 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRUB2O95900 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRUB2O95900 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRUB2O95900 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRUB2O95900 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRUB2O95900 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRUB2O95900 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRUB2O95900 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRUB2O95900 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRUB2O95900 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRUB2O95900 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRUB2O95900 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRUB2O95900 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRUB2O95900 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRUB2O95900 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRUB2O95900 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRUB2O95900 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRUB2O95900 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRUB2O95900 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRUB2O95900 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRUB2O95900 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRUB2O95900 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRUB2O95900 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRUB2O95900 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRUB2O95900 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRUB2O95900 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRUB2O95900 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRUB2O95900 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRUB2O95900 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRUB2O95900 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRUB2O95900 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRUB2O95900 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRUB2O95900 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRUB2O95900 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRUB2O95900 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRUB2O95900 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRUB2O95900 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRUB2O95900 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRUB2O95900 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRUB2O95900 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRUB2O95900 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRUB2O95900 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRUB2O95900 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms