Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPNE6O95741 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPNE6O95741 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms