Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
POLR3AO14802 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
POLR3AO14802 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
POLR3AO14802 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
POLR3AO14802 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
POLR3AO14802 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
POLR3AO14802 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
POLR3AO14802 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
POLR3AO14802 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
POLR3AO14802 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
POLR3AO14802 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
POLR3AO14802 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
POLR3AO14802 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
POLR3AO14802 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
POLR3AO14802 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
POLR3AO14802 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
POLR3AO14802 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
POLR3AO14802 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
POLR3AO14802 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
POLR3AO14802 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
POLR3AO14802 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
POLR3AO14802 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
POLR3AO14802 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
POLR3AO14802 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
POLR3AO14802 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
POLR3AO14802 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
POLR3AO14802 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
POLR3AO14802 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
POLR3AO14802 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
POLR3AO14802 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
POLR3AO14802 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
POLR3AO14802 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
POLR3AO14802 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
POLR3AO14802 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
POLR3AO14802 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
POLR3AO14802 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
POLR3AO14802 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
POLR3AO14802 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
POLR3AO14802 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
POLR3AO14802 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
POLR3AO14802 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
POLR3AO14802 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
POLR3AO14802 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
POLR3AO14802 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
POLR3AO14802 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
POLR3AO14802 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
POLR3AO14802 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
POLR3AO14802 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
POLR3AO14802 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
POLR3AO14802 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
POLR3AO14802 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
POLR3AO14802 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
POLR3AO14802 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
POLR3AO14802 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
POLR3AO14802 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
POLR3AO14802 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
POLR3AO14802 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
POLR3AO14802 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
POLR3AO14802 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
POLR3AO14802 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.29■■■■□ 3.08
POLR3AO14802 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
POLR3AO14802 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
POLR3AO14802 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
POLR3AO14802 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
POLR3AO14802 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
POLR3AO14802 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
POLR3AO14802 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
POLR3AO14802 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
POLR3AO14802 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
POLR3AO14802 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
POLR3AO14802 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
POLR3AO14802 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
POLR3AO14802 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
POLR3AO14802 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
POLR3AO14802 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
POLR3AO14802 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
POLR3AO14802 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
POLR3AO14802 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
POLR3AO14802 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
POLR3AO14802 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
POLR3AO14802 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
POLR3AO14802 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
POLR3AO14802 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
POLR3AO14802 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
POLR3AO14802 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
POLR3AO14802 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
POLR3AO14802 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
POLR3AO14802 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
POLR3AO14802 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
POLR3AO14802 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
POLR3AO14802 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
POLR3AO14802 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
POLR3AO14802 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
POLR3AO14802 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
POLR3AO14802 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
POLR3AO14802 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
POLR3AO14802 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
POLR3AO14802 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
POLR3AO14802 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
POLR3AO14802 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms