Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
J3QR89 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
J3QR89 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
J3QR89 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
J3QR89 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
J3QR89 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3QR89 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3QR89 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3QR89 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3QR89 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3QR89 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3QR89 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3QR89 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3QR89 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3QR89 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3QR89 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3QR89 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3QR89 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3QR89 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3QR89 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3QR89 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
J3QR89 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
J3QR89 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
J3QR89 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
J3QR89 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
J3QR89 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
J3QR89 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
J3QR89 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
J3QR89 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
J3QR89 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
J3QR89 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
J3QR89 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
J3QR89 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
J3QR89 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
J3QR89 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
J3QR89 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
J3QR89 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
J3QR89 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
J3QR89 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
J3QR89 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
J3QR89 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
J3QR89 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
J3QR89 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
J3QR89 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
J3QR89 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
J3QR89 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
J3QR89 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
J3QR89 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QR89 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QR89 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QR89 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QR89 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QR89 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QR89 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QR89 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QR89 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QR89 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QR89 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QR89 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QR89 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
J3QR89 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QR89 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
J3QR89 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QR89 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QR89 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QR89 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QR89 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QR89 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QR89 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QR89 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QR89 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QR89 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QR89 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QR89 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QR89 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QR89 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QR89 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QR89 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QR89 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QR89 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
J3QR89 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
J3QR89 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
J3QR89 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
J3QR89 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
J3QR89 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
J3QR89 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
J3QR89 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
J3QR89 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
J3QR89 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
J3QR89 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
J3QR89 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
J3QR89 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
J3QR89 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
J3QR89 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
J3QR89 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
J3QR89 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
J3QR89 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
J3QR89 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
J3QR89 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
J3QR89 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms