Protein–RNA interactions for Protein: B2RXH2

KDM4E, Lysine-specific demethylase 4E, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4EB2RXH2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4EB2RXH2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KDM4EB2RXH2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM4EB2RXH2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms