Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USH1CQ9Y6N9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USH1CQ9Y6N9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USH1CQ9Y6N9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USH1CQ9Y6N9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USH1CQ9Y6N9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USH1CQ9Y6N9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
USH1CQ9Y6N9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USH1CQ9Y6N9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms