Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F9

RIPOR2, Rho family-interacting cell polarization regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR2Q9Y4F9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR2Q9Y4F9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIPOR2Q9Y4F9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIPOR2Q9Y4F9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIPOR2Q9Y4F9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIPOR2Q9Y4F9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIPOR2Q9Y4F9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIPOR2Q9Y4F9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPOR2Q9Y4F9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPOR2Q9Y4F9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPOR2Q9Y4F9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPOR2Q9Y4F9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPOR2Q9Y4F9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPOR2Q9Y4F9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPOR2Q9Y4F9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPOR2Q9Y4F9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms