Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms