Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAB39Q9Y376 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAB39Q9Y376 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms