Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms