Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG6Q9Y2V7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms