Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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