Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC12A4Q9UP95 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms