Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJD2Q9UKL4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJD2Q9UKL4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJD2Q9UKL4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJD2Q9UKL4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJD2Q9UKL4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJD2Q9UKL4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJD2Q9UKL4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJD2Q9UKL4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJD2Q9UKL4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJD2Q9UKL4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJD2Q9UKL4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJD2Q9UKL4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJD2Q9UKL4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJD2Q9UKL4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJD2Q9UKL4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJD2Q9UKL4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GJD2Q9UKL4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GJD2Q9UKL4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJD2Q9UKL4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GJD2Q9UKL4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJD2Q9UKL4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJD2Q9UKL4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJD2Q9UKL4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GJD2Q9UKL4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJD2Q9UKL4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms