Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CASP8AP2Q9UKL3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP8AP2Q9UKL3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP8AP2Q9UKL3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP8AP2Q9UKL3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP8AP2Q9UKL3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP8AP2Q9UKL3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP8AP2Q9UKL3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP8AP2Q9UKL3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms