Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms