Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SALL4Q9UJQ4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms