Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPUSD1Q9UJJ7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms