Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms