Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF2Q9UG63 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms