Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms