Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF7Q9UBF6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF7Q9UBF6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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