Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms