Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms