Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALKBH4Q9NXW9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms