Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX14

NDUFB11, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB11Q9NX14 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms